Восточно-крымское отделение Крымской академии наук было создано решением Президиумом КАН 07.02.2007 г. Руководитель отделения академик Б. Н. Панов. В составе отделения известные ученые академики В. А. Брянцев и Е. П. Губанов, члены-корреспонденты КАН А. А. Солодовников, Б. Г. Троценко и др.
Усилия организаций и ученых, вошедших в состав Восточно-крымского отделения, направлены на исследовательскую и инновационную деятельность, обеспечивающую устойчивое развитие региона. В первую очередь это традиционные для региона виды деятельности (рыбная промышленность, морской транспорт, рекреация, историко-археологическое и этно-социальное наследие), а также образовательно-просветительская деятельность, связанная с проблемами экологии.

Рыбохозяйственные исследования были направлены на экологизацию, борьбу с незаконным промыслом, развитие морской аквакультуры. Разработаны проекты комплексного рыбохозяйственного освоения озера Тобечик, обоснования и режимы на создание специализированного производственного комплекса по искусственному воспроизводству жизнестойкой молоди камбаловых и кефалевых видов рыб. В 2012 году впервые в Украине в центре рыбоводства Юг НИРО в с. Заветное была выращена и выпущена в море крупная партия жизнестойкой молоди черноморского калкана.

Подготовлен инвестиционный проект «Донузлавмарикультура», в рамках которого предусмотрено создание системы предприятий по воспроизводству, выращиванию и глубокой переработке гидробионтов (моллюсков, водо¬рослей, рыб) и развитию рекреационного потенциала региона. В 2009–2010 годах на базе рыбоводно-мидийного хозяйства ООО «Донузлав-Аквакультура» впервые в Украине было создано садковое хозяйство по выращиванию лососевых и кефалевых видов рыб в поликультуре с дву-створчатыми моллюсками.

Исследовано современное состояние остатков популяции черноморской устрицы с целью оценки возможности их искусственного выращивания, а также — возможности использования двустворчатых моллюсков-аутоакклиматизантов как объектов промысла и культивирования в Азово-Черноморском бассейне.

В плане оценки техногенных воздействий определены особенности изменений в экосистеме Керченского пролива, связанные со строительством дамбы в Тузлинской промоине и аварийным разливом нефти в ноябре 2007 года.

О неблагополучном состоянии токсико-мутагенного фона территории Керченского полуострова свидетельствуют результаты исследований углеводородного загрязнения почв и внутренних вод полуострова.

Успешно развивается медико-рекреационное направление. Разработаны рецептуры, прошли проверку и нашли успешное применение специальные продукты питания функционального назначения — биологически активные препараты и диетические добавки природного происхождения из гидробионтов и растительного сырья.