12 мая 1993 года была создана Крымская Академия Наук, которая объединила ведущих ученых университетов, научных центров и производственных предприятий, учреждений, объединений Крыма с целью направить их усилия на решение актуальных, жизненно важных для общества задач. Для реализации этих задач были созданы десять отделений по направлениям научных знаний (естественных наук, медико-биологических, экологии и рекреации, архитектуры и строительства, техники и современных технологий, аграрных наук, мореведения, гуманитарных, социальных и экономических наук), а также два региональных отделения — Севастопольское и Восточно-Крымское (г. Керчь). В целом, Крымская Академия Наук объединила более 200 известных ученых Крыма, а также 25 иностранных членов - ученых из России, США и ряда стран Западной Европы.

Академия совместно с другими научными организациями выполнила ряд важных для Крыма научно-исследовательских работ в области экологии и охраны уникальной крымской природы, инновационной деятельности и использования ресурсного потенциала Крыма, курортологии, энергосбережения, мореведения, архитектуры и строительства, развития аграрного сектора и др.

В сборниках «Труды Крымской академии наук» (1995-2015 гг.) отражены фундаментальные научные интересы и решаемые прикладные актуальные для Крыма задачи в области экологии, медицины, философии, рекреации, аграрного сектора, истории, социологии, информатики и т.д. В известном дискуссионно-аналитическом сборнике «Вопросы развития Крыма», основанном в 1995 году совместно с Комитетом по науке и региональному развитию при Правительстве Автономной Республики Крым, и в приложениях к нему (в 1995-2002 гг. сделаны 33 выпуска) опубликовано 866 статей и инновационных приложений. Общий объем этих изданий составил более 393 авторских листов.

Кроме издательской деятельности, проводились конференции, семинары, симпозиумы регионального, всеукраинского и международного уровней, где обсуждались вопросы устойчивого развития АРК, проблемы формирования и реализации региональной научно-технической политики в Украине, вопросы энергосбережения и развития возобновляемых источников энергии в Крыму, обсуждались медико-биологические проблемы и принимались решения по курортно-рекреационным, бальнеологическим, сырьевым и другим ресурсам, по вопросам развития агропромышленного комплекса и многим другим.
Учеными Крыма разработан и передан Правительству АРК ряд концептуальных программ научно-технического и инновационного развития Крымской автономии. Среди них:
- «Стратегия развития АРК до 2015 г.»;
- «Программа интегрированного управления водными ресурсами», 2005 г.;
- «Крымская стратегия обращения с ТБО», 2006 г.

В последние годы по заданию Правительства АРК выполнены исследования по темам:
- Комплексная оценка воздействия добычи песка на экосистему озера Донузлав, 2008 г.
- Обоснование приоритетных направлений эколого-социально-экономического развития Западного Крыма, 2011 г.
- НИР по охране подземных вод и ликвидации источников их загрязнения на горе Ай-Петри, 2012 г.

Учеными КАН проведены независимые общественные экспертизы проектов строительства транспортно-промышленного комплекса «Донузлав», 2006 г., угольного терминала в г.Севастополе, 2008 г., карьера по добыче в Горном Крыму известняка для Красноперекопского содового завода, 2009 г., которые повлияли на принятие решений о недопустимости строительства в курортном Крыму экологически небезопасных предприятий.
В 2010-2013 гг. Академия выполнила ряд крупных гуманитарных проектов:
- «Достояние» - в рамках деятельности Международного межакадемического союза (Крым-Москва-Ганновер). Высокой наградой Европейской академии наук был отмечен в связи с юбилеем академик Б.М.Владимирский, ведущий научный сотрудник Крымской астрофизической обсерватории - за выдающиеся достижения в астрофизике, биофизике солнечно-биосферных связей, физике космических лучей.
- Продолжается крупный издательский проект - журнал «Брега Тавриды» - главный редактор Г.С.Домбровская, академик КАН.
- Начат новый интересный и перспективный издательский проект — научно-популярный журнал «Экомир» совместно с ассоциацией «Экология и мир».
- По инициативе академика Н.В.Масловой в Крыму совместно с Министерством образования и науки реализуется уникальный проект по педагогике ноосферного образования.
Неоценимым вкладом в развитие мировой науки и культуры явились труды:
- «Генезис души» академика И.Н.Шваневой (г.Москва, иностранный член КАН);
- «Антропологический манифест», «Оправдание мудрости» вице-президента КАН, академика Ф.В.Лазарева и М.К.Трифоновой;
- Учебники по педагогике академика А.В.Глузмана;
- «Антология крымской поэзии» академика В.П.Терехова и др.;
- Международным брендом стал фестиваль «Великое русское слово», проводимый под патронатом Верховного Совета АР Крым.

Ключевыми фигурами в обеспечении литературной части программы на протяжении последних лет являются академики КАН Терехов В.П., Лазарев Ф.В., Белый Л.К., Шалюгин Г.А., Домбровская Г.С., Жан-Клод Фрич (Франция, иностранный член КАН).

В последние годы КАН прикладывала усилия по расширению международного сотрудничества с учеными и научными центрами стран ближнего и дальнего зарубежья, усилились плодотворные контакты с учеными России: Москвы, С.Петербурга, Казани, Екатеринбурга, а также Польши в реализации совместных проектов:
- Создание мемориального комплекса профессора Н.А.Головкинского в Профессорском уголке в г.Алуште. Осенью 2012 г. состоялась Вторая международная конференция памяти НА.Головкинского на тему: «Природа и общество: ноосферные тенденции теории взаимодействия». Академия получила в долгосрочную аренду помещение в с.Лазурном, находящееся на территории бывшей усадьбы профессора Головкинского Н.А. — основателя Профессорского уголка у подножия горы Кастель. Решением Президиума КАН создается музей Профессорского уголка им. Н.А.Головкинского, директором которого назначен правнук профессора П.К.Тыглиянц-Головкинский (член-корреспондент КАН).
- В Алуште ежегодно проводится традиционная Международная конференция по инновационному развитию «Проблемы и перспективы инновационного развития экономики», которая среди ее участников получила неофициальное название «Крымский Давос». Бессменный координатор этого проекта вице-президент КАН, академик Слепокуров А.С.
- В НАПКСе проведена международная конференция «Энергия — 2012» совместно с учеными Польши.

На состоявшейся в Екатеринбурге 31 мая - 1 июня 2012 г. Международной научно-практической конференции «Экологические проблемы использования природных и
биологических ресурсов в сельском хозяйстве» КАН заключены договоры о научном сотрудничестве с Уральской государственной сельскохозяйственной академией и Уральским научно-исследовательским ветеринарным институтом Россельхозакадемии.

Действительные члены КАН — экологи, социологи, географы и биологи поддержали проект создания сафари-парка «Тайган» в Белогорском районе АР Крым. По мнению экспертов, у сафари-парка «Тайган» большие перспективы в организации туристической, природоохранной, образовательной, научной, учебной, рекреационно-оздоровительной и иных видов деятельности. Это важный аргумент против планов наращивания в Крыму горнорудного, химического и других видов экологически небезопасных производств. И это главный аргумент в пользу развития новых курортно-рекреационных и туристических объектов в Крыму.
- Новой организационной формой деятельности КАН явилось создание по инициативе академиков Котолупова О.А. и Хриенко П.А. «Крымского клуба интеллектуальных инициатив». В заседании клуба принимали участие члены Президиума КАН, ведущие ученые Крыма, депутаты Верховного Совета АРК и члены Правительства, представители СМИ.

Члены академии принимают участие в работе Постоянных комиссий Верховного Совета АРК, в работе коллегий Министерств и комитетов Совмина АРК в области культуры, науки, здравоохранения, образования, экологии, экономики, энергетики, курортного дела, регионального развития и др.
Много делают крымские ученые в университетах и научных центрах. Об этом свидетельствуют значимые научные труды и высокие государственные и республиканские премии, награды, звания наших лидеров:
Багрова Н.В. - героя Украины, Академика национальной Академии Наук Украины, ректора ТНУ им. В.И.Вернадского, действительного члена КАН, профессора, д.г.н.;
Баталина А.С. - героя Украины, директора ЗАО «Фиолент», заслуженного деятеля промышленности Украины, действительного члена КАН, R.T.H., депутата В.С.АРК;
Якубова Ф.Я. — героя Украины, ректора КГИПУ, члена Президиума КАН, профессора, д.т.н.;
Бабанина А.А. - ректора КМУ им. С.ИТеоргиевского, действительного члена КАН, профессора, д.м.н.;
Федоркина С.И. - ректора НАПКС, члена Президиума КАН, профессора, д.т.н., лауреата Государственной премии Украины, заслуженного деятеля науки и техники Украины, депутата B.C. APK;
Николаева Е.В. - дважды лауреата премии АРК в области науки и техники, профессора, д.с.н., вице-президента КАН.
Крымчанам хорошо известны имена профессоров, действительных членов КАН: Абдулаева Р.А., Баркова Я.И., Бережной И.В., Богадельникова И.В., Богданова Н.Н., Бокова В.А., Буглака Н.П., Василенко В.А., Ветровой Н.М., Гаевской А.В., Губанова Е.П., Ены В.Г., Ефетова К.А., Ефремова А.В., Загорулъко А.К.„ Закусилова Н.А., Каладзе Н.Н., Ковалева В.Л., Котолупова О.А., Короленко Е.С.„ Кубышкина А.В., Лазарева Ф.В., Лущика А.В., Морозова А.Д., Михуринской Е.А., Новикова Ю.Н., Неменко А.В., Олиферова А.Н., Османова И.Х., Панова Б.Н., Пинчук Т.А., Поликарпова Г.Г., Подсолонко В.А., Русяева В.Ф., Рыбалко А.Н., Славгородской-Курпиевой Л.Е., Сухова А.К., Сысоева Н.П., Тереза Э.И., Хриенко П.А., Юдина В.В., Юровского Ю.Г., Ячменевой В.М., вице-президента КАН А.С.Слепокурова и многих других ученых, являющихся гордостью крымской науки и прилагающих огромные усилия по созданию и реализации образовательного, научного и инновационного потенциала Крыма.